Sisältö
- Kasvavan kulttuurin määrittely
- Diagnosoitavat infektiotyypit
- Kulttuurityypit
- Kulttuureissa käytetyt ainesosat
Joten mikä kulttuuri tarkalleen ottaen on, ja miten se auttaa infektion diagnosoinnissa?
Kasvavan kulttuurin määrittely
Kulttuuri on tapa kasvattaa mikrobia laboratoriossa. Monet bakteerit, sienet, loiset ja virukset voidaan kasvattaa laboratoriossa, kun käytetään asianmukaisia olosuhteita. Kasvavan viljelmän tarkkoja ominaisuuksia voidaan käyttää spesifisen mikrobin tunnistamiseen. "Selektiivisen aineen" käyttöä voidaan käyttää mikrobin ominaisuuksien määrittämiseen. Esimerkiksi Staph aureus metisilliiniä (selektiivinen aine) sisältävässä viljelmässä osoitus metisilliiniresistentistä Staph aureus (MRSA). Metisilliini on eräänlainen antibiootti, joten bakteerit, jotka kasvavat metisilliiniä sisältävässä viljelmässä, ovat resistenttejä kyseistä antibioottia käyttävälle hoidolle.
Nämä viljelmät ovat yleensä levyillä tai putkissa, jotka sisältävät erityisruokaa, joka sallii tietyn patogeenin tai patogeeniryhmän kasvaa. Tämän avulla laboratoriotyöt voivat tunnistaa kasvavan mikrobin. Laboratoriotyöntekijöiden on ehkä kasvatettava mikrobia useilla erilaisilla viljelylevyillä (tai putkilla) tarkan mikrobin määrittämiseksi. Tämä voi olla kuin Sherlock Holmesin etsiväpalapeli.
Diagnosoitavat infektiotyypit
Diagnostisia viljelmiä käytetään yleisesti tarttuvien mikrobien tunnistamiseen virtsasta (virtsatieinfektiot), ulosteesta (ripuli- ja ravintotaudit), sukupuolielimistä, kurkusta (strep-kurkusta) ja ihosta (ihoinfektiot) eristetyistä näytteistä. Muista ruumiinosista, kuten verestä ja selkäytimestä, eristettyjä näytteitä voidaan myös viljellä; tällaiset infektiot ovat yleensä vakavampia ja vaativat sairaalahoitoa.
Kulttuurityypit
Kulttuureja on kolme päätyyppiä:
Kiinteä kulttuuri
Bakteerit ja sienet voivat kasvaa kiinteällä pinnalla, joka on valmistettu ravinteiden, suolojen ja agarin (merilevistä eristetyn hyytelöimisaineen) seoksesta. Tämä on usein kämmenesi kokoisella lautasella. Monet ovat pieniä astioita punaisella geelillä, jotkut geelit ovat keltaisia tai muita värejä. Yksi kiinteälle pinnalle asetettu mikrobi voi kasvaa pesäkkeiksi tai yksittäisiksi ryhmiksi, jotka koostuvat tuhansista soluista. Pesäkkeet koostuvat klooneista, joissa kaikki solut ovat identtisiä toistensa kanssa. Tämä ominaisuus tekee kiinteistä viljelmistä niin hyödyllisiä mikrobien tunnistamiseksi. Erilaisilla pesäkkeillä eri lajeista on selkeät piirteet ja ominaisuudet (esim. Pesäkkeen väri, koko, muoto ja kasvunopeus), jotka auttavat mikrobiologeja tunnistamaan mikrobin.
Nestemäinen kulttuuri
Nestemäistä viljelmää kasvatetaan ravinteiden ”väliaineessa” tai ”liemessä”. Mikrobien kasvu havaitaan, kuinka nopeasti liemi samenee. Sameampi liemi tarkoittaa tyypillisesti suurempaa määrää mikrobeja. Nestemäiset viljelmät voivat usein sisältää useita mikrobilajeja, joten ne ovat yleensä vähemmän hyödyllisiä kuin kiinteät viljelmät bakteerien ja sienien diagnosoinnissa. Nesteviljelmät ovat kuitenkin hyödyllisempiä loisten diagnosointiin, jotka eivät muodosta normaaleja pesäkkeitä kiinteissä viljelmissä.
Soluviljely
Joitakin mikrobeja, kuten klamydia tai riketsia, ja viruksia ei voida kasvattaa kiinteissä tai nestemäisissä viljelmissä, mutta niitä voidaan kasvattaa ihmisen tai eläimen soluissa. Ihmisen tai eläimen soluviljelmiä käytetään "infektoimalla" soluviljelmä mikrobilla ja tarkkailemalla vaikutusta soluihin. Esimerkiksi monilla viruksilla on haitallisia tai "sytopaattisia" vaikutuksia soluihin, jotka mikrobiologit voivat havaita. Koska soluviljelymenetelmät ovat yleensä erikoistuneempia ja vaativat enemmän työtä ja pidempiä diagnoosiaikoja, soluviljelyä käytetään yleensä toissijaisesti muiden diagnostisten menetelmien kanssa. Joidenkin mikrobien kasvaminen voi olla erityisen vaikeaa.
Kulttuureissa käytetyt ainesosat
Viljelmän tietystä tyypistä riippuen ainesosat vaihtelevat. Käytössä on monia erilaisia ainesosia, koska niiden avulla voidaan päätellä, missä mikrobi voi ja ei voi kasvaa, mikä tunnistaa mikrobin. Usein se ei kerro meille paljon itse organismista, vaan auttaa meitä päättelemään organismin nimen. Jokaisella mikrobilla on oma erityinen maku kulttuurigeeleissä ja ainesosissa. Yleensä useimmat kulttuurit edellyttävät seuraavien yhdistelmää:
- Aminotyyppilähde: pilkotut proteiinit
- Kasvutekijät: veri, seerumi tai hiivauute
- Energialähde: sokerit, hiilihydraatit
- Suolat pH: n puskuroimiseksi: fosfaatti, sitraatti
- Mineraalit: kalsium, magnesium tai rauta
- Selektiiviset aineet: antibiootit tai kemikaalit
- Indikaattorit tai väriaineet: happamustasojen määrittämiseksi
- Hyytelöimisaine kiinteille viljelmille: agar